自 從6月29日以後，人類聯邦失去了對地球的製空權，而獲取製空權的船員們則用自己強大的飛行器對亞太地區進行了一番狂轟亂炸。此時在亞太地區，人類聯邦首都所在地，幾乎很難找到還完好無損的城市。
在丟掉製空權之後，人類被迫進入早已經修建好的地下城，以地下城為據點對天空中的船員展開遊擊和騷擾。不過讓人類感覺絕望的是，他們最後的法寶遊擊戰對船員文明起不到任何的作用。在人類進入地底後，船員們對隱蔽起來的核聚變電站進行了瘋狂攻擊，以至於所有地下城都失去了能源供給。
地下城的正常運行全靠核聚變電站提供電力，此時失去了能源，他們連最基本的氣體轉換都無法做到，更不要說保持整個地下城的生態平衡。最開始時，各種排泄出去的廢氣無法被清除，整個地下城一下子烏煙瘴氣，變得奇臭無比。
細菌在空氣中彌漫，很多人接二連三地感染上疾病。
而緊接著，二氧化碳的異常增多、氧氣的供應不足、通風口進入的氣體沒有經過排毒等等情況全部出現，讓地下城逐漸成為了一處死亡之地。
船員攻擊核聚變電站後就沒有繼續攻擊，可即便如此，人類也沒有堅持過三日。在第二天的時候，地下城就大規模崩潰，幸存下來的人沿著地下通道爭先恐後地往地表逃去，地下城變成了人間地獄。
北京時間，7月3日，清晨6點26分，聯邦政府代表人類向母船發射出投降的信號。
經過中國方麵的組織，各國地下城還存活的人類被轉移出來。抵達地表的人類沉默地呆在早已經變成廢墟的舊國度，靜靜地等待母船的消息。如果對方接受投降，他們才能作為寵物繼續在這顆星球上生存下去；如果它們拒絕，他們連做牛做馬的資格也沒有，那麽就隻能燃燒自己的生命，與船員們同歸於盡。